论科学思维的三篇文章，必须回过头来将中医完整地再解说一下，从中更能理解中医文化中出现的现象，只有在正确的科学思维下才能看中医现状与历史，这是第一篇，先说明中医整体思维是什么，与西医的区别。
任何科学门类都离开不正确的方法论的指导，但从现状来看，虽然有科普将科学意识深入人心，但真正能运用科学，用正确的方法论指导实践的能力还很低。其根本原因在于，只有科学知识在传授传播中，是一种被动的接受，而不是一种主动的思维，这样往往变化而成宗教式的科学主义，似乎传播的学科知识就是对的，就是客观的。这些学科知识的应用本身是要应用在自己学科内，而不能随意地扩大与演绎的。
事实上，科学的相关学科具有强烈的人类意识的，是客观世界的主观反映后所建立的理论范式，用错误的方法研究客观事物得到的就不是正确的科学理论。同时经过验证的理论同样有它的使用范围，不能超范围的应用，必须在产生理论的条件下进行应用。
中医是整体哲学与科学的结合，是道与术的结合，是理论与实践的结合。但百年来，西方文化在中国传播后，对西方文明的膜拜使一些近代文人中影响的人物，批判中医，对中医的认识与歪曲影响深远直至现在。中医是集东方文明的大成，它既有文化的内涵，又有哲学的厚重，还有科学的严谨，成为了东西方文明交锋的焦点。东西方文化的交锋不仅是民族的交锋，同时还是两种世界观的碰撞，是整体观与分析还原理论的矛盾，还有辩证法与机械论的对比，也有多元复杂思维与简单二元思维的矛盾，因此有必须站在思维、哲理的角度来进行中西医的对比。
整体思维与分析还原思维在中国古代都有论述，就举阳明心学来说。阳明心学是中国传统哲学集大成者，他的著作《传习录》就有这种对比，“道无精粗，人之所见有精粗。如这一间房，人初进来，只见一个大规模如此。处久便柱壁之类，一一看得明白。再久，如柱上有些文藻，细细都看出来。然只是一间房。”
而中医《黄帝内经素问．阴阳离合论》“阴阳者，数之可十，推之可百。数之可千，推之可万。万之大，不可胜数，然其要一也。”表述整体是阴阳两分的，而事间万物则可以继续分析，无穷尽也，但是不能忘了必须要有最重要的原则“然其要一也”。《道德经》中“道生一，一生二，二生三，三生万物”，同样也是这些道理，整体是需要分析的，分析在整体的原则下。
先哲语言的哲理是相同的，宇宙万物本是一体，然后人类的观察意识将它们数之、推之，用分析的方法来解释宇宙万物，这里可以说就是西方科学、西方哲学思维，但是西方哲学、西方科学少了后面的指导“然其要一也”“然只是一间房”。西方医学也是如此，我们知道各种的解剖关系，生理系统的关系，但是它们如同房间里的柱子、墙壁一样，是不完整的。肯定是无法成为完整的房子的功能。如果连这种意识都没有，那么科学是无法发展的，房子可以继续往下分析，观察，可以用到里面的很多的用法，但不能忘记整体性。所以西方的哲学都是分析思维，他们的发展没有成为完整的哲学理论，康德都没有这说法，乃至后来的黑格尔、马克思也同样没有意识到这样，才有种种的唯物主义与唯心主义的争论，这是人的争论而非对存在的争论。
上面哲理也曾写过这样的类比：放在面前的一碗饭，平时吃的时候没感觉，但研究它的时候总是想弄清有多少蛋白质，淀粉，脂肪，纤维素等等，但别忘记了它仍然是一碗饭，而不是只吃下蛋白质，淀粉，脂肪，纤维素等等，而是吃下饭这个整体，因为原本整体才是实际的，用的是整体的思维，细分成各种的营养素，是一种分析思维。分析思维的缺点在于不管分出来的各种物质必须要构成整体才能成为实际，但分析出来的物质并不能完成重构成实际的整体，比如分析成各种成分成份的饭，并不能真正重组成饭的实际。
“道无精粗，人之所见有精粗”，因此需要改变的是思维，思维定式的问题，西医就象这些蛋白质，淀粉，脂肪，纤维素，中医就象这碗饭，当代人大多是只有分析还原的思维定式，注定理解中医者少，即使有点民族情结，因此不能只把中医普及放在传播文化的轨道上，更应该放在整体客观的科学思维上。
医学上，比如人得了糖尿病是血糖高，治血糖吧去降血糖啊，现代医学说吃少点目的是降血糖，运动一下降血糖，打胰岛素降血糖，目标变成了唯一。但是别忘记了人的生活它是一个完整的，健康不只是降血糖，你还要吃饭，睡觉，有喜怒哀乐，都得学会知道。它与饭的不同在于饭是死的，人是活的，吃饭。睡觉，有喜怒哀乐，都会对血糖造成影响，而且不只是对血糖造成影响。而血糖为什么升高也是不只是胰腺不足的原因，还有相它升糖激素的影响，象肾上腺素，甲状腺等等，因此我们不能只看到血糖，而是要看到生活的方方面面，方方面面都是否按照整体的、正确的规律。事实上，只会降血糖的人住往并发症的可能性更大，因为他们忽视了其它因素。
有了整体思维，也就知道可能对人的健康产生影响的因素就不止外在的细菌病毒，不会只